Каждый USB порт предназначен для нагрузки с потреблением тока не более 500 мА. Сообщение может выскакивать, если нагрузка по току превышает допустимую. Самый простой вариант: для USB-джойстика использовать дополнительный внешний блок питания на 5 вольт.